A Igreja da Misericórdia corresponde a uma construção dos inícios do séc. XVIII promovida pelo bispo D.Álvaro Abranches de Noronha, que acumulou o episcopado com a provedoria da Santa Casa da Misericórdia de Leiria entre 1697 e 1745. Trata-se de um edifício de planta retangular com uma só nave e uma ampla capela-mor, tendo a norte uma pequena sacristia. Esta Igreja enquadra-se naquilo que se convencionou chamar "arquitectura portuguesa Estilo Chão". Nela trabalhou, pelo menos no período entre 1717 e 1722, o mestre de obras Francisco Gomes.
A Irmandade da Misericórdia de Leiria terá sido criada em 1544, tendo esta igreja substituído de certa forma, na área baixa da cidade, a função desempenhada pela Igreja de S. Martinho (demolida entre 1546 e 1549), pelo menos até à construção da Sé, em 1559.
A comuna judaica girava em torno da sinagoga, situada no local da atual Igreja da Misericórdia, um templo cristão com reminiscências maneiristas e barrocas, que foi classificado como Monumento de Interesse Público, em 2015.